Peritaje sobre copias fotostaticas

En una acusación por uso de documentos falsos, solicite aportar un peritaje en documentoscopia y grafologia lo cual el juez acepto, ya que el ministerio publico militar aporto uno de un perito militar en la misma materia, quien determino que los documentos de la acusación facturas eran falsos, sin embargo cuando solicite el acceso a estos documentos para que mi perito los examinara estos no aparecen, el departamento que debía resguardarlos manifiesta no saber en donde están, otro departamento manifiesta tener "copias certificadas" de algunos de estos documentos, el juez verbalmente me dijo que ordenaría a mi perito realizar su trabajo sobre estas "copias certificadas", esto me deja en desventaja frente al perito militar que SI tuvo acceso a los originales.
¿Qué puedo hacer?¿Existe alguna jurisprudencia al respecto que me favorezca?¿Cómo puedo manifestar esta clara desventaja en la que me colocan?
Gracias