EMBARAZO SIN INCAPACIDAD

Buenas tardes Tengo una embarazada en la empresa, su puesto es auditora de inventarios y requiere estar en campo, al día de hoy tiene 16 semanas de embarazo aproximadamente, y dos incapacidades por amenaza de aborto, de 3 y 7 días del mes de enero, No ha trabajado desde hace dos meses, ya que alega que le duele mucho su vientre, que se marea y que no puede caminar, la tenemos en su casa descansando y con goce sueldo, comenta que el IMSS no le quiere dar incapacidad pero su embarazo es de alto riesgo ¿se puede dar de baja a esta empleada en este caso sin alguna consecuencia legal? obvio con todas las prestaciones y liquidada al 100